Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW1

AP2M1, AP-2 complex subunit mu, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1Q96CW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2M1Q96CW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2M1Q96CW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms