Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STAG3L4Q8TBR4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAG3L4Q8TBR4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms