Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLGN4YQ8NFZ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLGN4YQ8NFZ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms