Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms