Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms