Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01551Q86U37 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01551Q86U37 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms