Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
WDR53Q7Z5U6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
WDR53Q7Z5U6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
WDR53Q7Z5U6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms