Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LETMD1Q6P1Q0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms