Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LCN8Q6JVE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LCN8Q6JVE9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms