Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C4orf17Q53FE4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms