Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LONRF2Q1L5Z9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF2Q1L5Z9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms