Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME3Q16798 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ME3Q16798 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ME3Q16798 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ME3Q16798 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME3Q16798 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME3Q16798 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME3Q16798 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME3Q16798 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME3Q16798 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME3Q16798 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME3Q16798 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME3Q16798 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME3Q16798 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ME3Q16798 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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