Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1EQ12965 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1EQ12965 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1EQ12965 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms