Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GRIN2AQ12879 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GRIN2AQ12879 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GRIN2AQ12879 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GRIN2AQ12879 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms