Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SREBF2Q12772 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF2Q12772 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SREBF2Q12772 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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