Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MRPL7YDR237W 879 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 BUD26YDR241W 288 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 SNA2YDR525W-A 240 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 CIR1YGR207C 786 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YIL152WYIL152W 708 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 HYM1YKL189W 1200 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YKR047WYKR047W 306 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 UBI4YLL039C 1146 nt4.63□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 RCE1YMR274C 948 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 NMD3YHR170W 1557 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 PIB1YDR313C 861 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 CSI1YMR025W 888 nt4.62□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 ERG29YMR134W 714 nt4.62□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOL162WYOL162W 648 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 PEP4YPL154C 1218 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 CEG1YGL130W 1380 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 TAF5YBR198C 2397 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YDL109CYDL109C 1944 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 PMT5YDL093W 2232 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 CPS1YJL172W 1731 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 RFT1YBL020W 1725 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 THI22YPR121W 1719 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 LHP1YDL051W 828 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 POP6YGR030C 477 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 COA3YJL062W-A 258 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 AIM23YJL131C 1071 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 ELF1YKL160W 438 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 HLJ1YMR161W 675 nt4.61□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 RAD28YDR030C 1521 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 PTM1YKL039W 1572 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 MNT2YGL257C 1677 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 ARG82YDR173C 1068 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 GEP7YGL057C 864 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YLR366WYLR366W 306 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YNL057WYNL057W 333 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 SPS19YNL202W 879 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 SOL1YNR034W 966 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 MVD1YNR043W 1191 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 RRI1YDL216C 1323 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 RAD57YDR004W 1383 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YBR139WYBR139W 1527 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 FAA3YIL009W 2085 nt4.6□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 AKL1YBR059C 3327 nt4.59□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 LDB17YDL146W 1476 nt4.59□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 DOS2YDR068W 933 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 LAC1YKL008C 1257 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YNK1YKL067W 462 nt4.59□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 HRT3YLR097C 1035 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YBL036CYBL036C 774 nt4.59□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATG29YPL166W 642 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 CDC4YFL009W 2340 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 KRE6YPR159W 2163 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 PRM2YIL037C 1971 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SSH4YKL124W 1740 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 NUR1YDL089W 1455 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 TED1YIL039W 1422 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SFI1YLL003W 2841 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 COS4YFL062W 1140 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 ZRT1YGL255W 1131 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 CLC1YGR167W 702 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 IMP3YHR148W 552 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SFK1YKL051W 1062 nt4.58□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF2Q12221 EMG1YLR186W 759 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 URA4YLR420W 1095 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 AAH1YNL141W 1044 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 ICY2YPL250C 411 nt4.58□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF2Q12221 SUT2YPR009W 807 nt4.58□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF2Q12221 AXL2YIL140W 2472 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 PRR2YDL214C 2100 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SAS10YDL153C 1833 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SEO1YAL067C 1782 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 ZPR1YGR211W 1461 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 RNY1YPL123C 1305 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 CPR4YCR069W 957 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SUI2YJR007W 915 nt4.57□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF2Q12221 THI80YOR143C 960 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 YPL278CYPL278C 303 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 MKS1YNL076W 1755 nt4.57□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF2Q12221 TPS3YMR261C 3165 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 PHO90YJL198W 2646 nt4.57□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 HST1YOL068C 1512 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 MSC2YDR205W 2175 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 snR63snR63 255 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 RRG1YDR065W 1098 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 LYS5YGL154C 819 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 RFC2YJR068W 1062 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SPC3YLR066W 555 nt4.56□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL217WYNL217W 981 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 HAT1YPL001W 1125 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 TIF5YPR041W 1218 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 SRB6YBR253W 366 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 REI1YBR267W 1182 nt4.56□□□□□ -1.68
PUF2Q12221 Q0017Q0017 162 nt4.56□□□□□ -1.68
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