Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNA1Q09470 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNA1Q09470 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms