Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TGM3Q08188 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGM3Q08188 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGM3Q08188 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms