Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNEQ04844 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNEQ04844 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNEQ04844 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms