Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX5P78411 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX5P78411 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX5P78411 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX5P78411 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX5P78411 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX5P78411 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX5P78411 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX5P78411 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX5P78411 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX5P78411 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX5P78411 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms