Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP4F2P78329 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms