Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSNK2A1P68400 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK2A1P68400 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms