Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS1P54277 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS1P54277 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS1P54277 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS1P54277 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS1P54277 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS1P54277 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS1P54277 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS1P54277 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS1P54277 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS1P54277 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS1P54277 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS1P54277 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS1P54277 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS1P54277 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms