Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3M2P53677 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP3M2P53677 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms