Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKN1CP49918 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKN1CP49918 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKN1CP49918 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms