Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC1P33527 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ABCC1P33527 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ABCC1P33527 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms