Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 SHC1-211ENST00000490667 727 ntTSL 214.72□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 TMPO-209ENST00000549938 696 ntTSL 423.28■■□□□ 1.329e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.259e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.259e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 TMPO-211ENST00000552831 743 ntTSL 22.16□□□□□ -2.069e-9■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 30.2
U2AF2P26368 RBM22-204ENST00000520132 2067 ntTSL 211.48□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ZNF800-207ENST00000485577 1478 ntTSL 527.02■■□□□ 1.923e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.311e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.971e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.91e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 NDUFAF6-218ENST00000523378 949 ntTSL 319.03■□□□□ 0.647e-12■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 NDUFAF6-208ENST00000519136 816 ntTSL 517.4■□□□□ 0.387e-12■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-221ENST00000490508 2148 ntTSL 517.23■□□□□ 0.352e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-215ENST00000462396 590 ntTSL 315.88■□□□□ 0.132e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.097e-12■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 215.28■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-204ENST00000409331 994 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-12■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-205ENST00000409344 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-216ENST00000462891 977 ntTSL 512.83□□□□□ -0.362e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-210ENST00000423095 2216 ntTSL 512.45□□□□□ -0.422e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.711e-10■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-214ENST00000446464 4761 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.812e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-211ENST00000429764 941 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.082e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-218ENST00000476734 521 ntTSL 48.29□□□□□ -1.082e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-209ENST00000418268 1209 ntTSL 37.53□□□□□ -1.22e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ELMOD3-217ENST00000466467 920 ntTSL 37.12□□□□□ -1.272e-14■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 NDUFAF6-214ENST00000521840 1057 ntTSL 23.51□□□□□ -1.857e-12■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 MSL1-207ENST00000580086 2638 ntTSL 29.64□□□□□ -0.873e-23■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 MSL1-211ENST00000583127 572 ntTSL 44.14□□□□□ -1.753e-23■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 MYCBP2-210ENST00000498073 1041 ntTSL 56.46□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 MYCBP2-206ENST00000482517 1581 ntTSL 26.23□□□□□ -1.419e-9■■■■■ 30.1
U2AF2P26368 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 ABHD18-204ENST00000473040 2139 ntTSL 519.48■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 SNHG1-201ENST00000535076 849 ntTSL 26.04□□□□□ -1.449e-11■■■■■ 30
U2AF2P26368 LPP-213ENST00000471917 998 ntTSL 310.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 LPP-202ENST00000415906 888 ntTSL 29.5□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 30
U2AF2P26368 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 30
U2AF2P26368 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 30
U2AF2P26368 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 30
U2AF2P26368 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-206ENST00000564991 3765 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-208ENST00000569051 901 ntTSL 59.18□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 NOMO2-207ENST00000567831 551 ntTSL 44.56□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 SMG1-212ENST00000566328 550 ntTSL 51.1□□□□□ -2.233e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 MGEA5-208ENST00000479811 695 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 MGEA5-209ENST00000482611 1664 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.231e-10■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-214ENST00000558863 1355 ntTSL 527.74■■■□□ 2.037e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-218ENST00000560196 1014 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-206ENST00000488625 6026 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-222ENST00000561212 1500 ntTSL 58.58□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-223ENST00000561304 1383 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.097e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-217ENST00000559858 2745 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-203ENST00000424869 887 ntTSL 58.1□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-216ENST00000559496 1381 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-221ENST00000561061 970 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.267e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-215ENST00000559476 1205 ntTSL 26.84□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-209ENST00000542879 3645 ntTSL 26.65□□□□□ -1.347e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-211ENST00000558440 886 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-204ENST00000437844 6246 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.397e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.497e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-210ENST00000557827 877 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.497e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.577e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-212ENST00000558655 2773 ntTSL 24.6□□□□□ -1.677e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-225ENST00000606671 571 ntTSL 42.81□□□□□ -1.967e-7■■■■■ 29.9
U2AF2P26368 ZEB1-224ENST00000606161 482 ntTSL 32.79□□□□□ -1.967e-7■■■■■ 29.9
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 409.7 ms