Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRAP19793 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RXRAP19793 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RXRAP19793 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RXRAP19793 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RXRAP19793 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RXRAP19793 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RXRAP19793 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RXRAP19793 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RXRAP19793 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RXRAP19793 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRAP19793 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRAP19793 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRAP19793 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRAP19793 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRAP19793 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RXRAP19793 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms