Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FCER1AP12319 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FCER1AP12319 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FCER1AP12319 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms