Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ESR1P03372 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ESR1P03372 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ESR1P03372 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ESR1P03372 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ESR1P03372 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ESR1P03372 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ESR1P03372 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ESR1P03372 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ESR1P03372 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ESR1P03372 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ESR1P03372 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ESR1P03372 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESR1P03372 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESR1P03372 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESR1P03372 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESR1P03372 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ESR1P03372 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESR1P03372 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESR1P03372 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESR1P03372 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ESR1P03372 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms