Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BHMG1C9JSJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMG1C9JSJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms