Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBY3A6NI87 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms