Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR23AA6NEV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR23AA6NEV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms