Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LYVE1Q9Y5Y7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LYVE1Q9Y5Y7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms