Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DTX4Q9Y2E6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DTX4Q9Y2E6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DTX4Q9Y2E6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms