Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEU3Q9UQ49 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEU3Q9UQ49 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms