Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APPL1Q9UKG1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms