Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms