Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPHK1Q9NYA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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