Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBN1Q9NPG3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBN1Q9NPG3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBN1Q9NPG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBN1Q9NPG3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBN1Q9NPG3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBN1Q9NPG3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBN1Q9NPG3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBN1Q9NPG3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms