Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC40A1Q9NP59 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms