Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPIFA1Q9NP55 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms