Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM8AQ9HCN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM8AQ9HCN3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM8AQ9HCN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms