Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3CQ99985 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3CQ99985 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms