Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOPBP1Q92547 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TOPBP1Q92547 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TOPBP1Q92547 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TOPBP1Q92547 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms