Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC44A1Q8WWI5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC44A1Q8WWI5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms