Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNDC9Q8TBE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FNDC9Q8TBE3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms