Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC00301Q8NCQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms