Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT2Q8N9I0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT2Q8N9I0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms