Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTD1Q8N815 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTD1Q8N815 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTD1Q8N815 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms